JAVA実行環境(WindowsからCentOS)

Windowsで開発したJavaServlet関連をCentOS7で実行したいと思っております。 Eclipseで開発しておりますが実行環境のフォルダごとDocumentRootに設定すればよいのでしょうか。それともtomcatのサンプルディレクトリに設定すれば良いのでしょうか。ソースからコンパイルの必要があるのでしょうか。 今一つ仕組が分からず、必要な範囲のファイルも分かっておりません。 tomcatのサンプルは動いております。 簡単なホームページの表示も問題ないようです。 PHPとmariadbの連携は問題無いようですのでDB連携は大丈夫と思います。 開発者は別でLINUXサーバに集めて一つのシステムとして実行したいと思っている初心者です。 宜しくお願い申し上げます。